در طرح نهضت ملی مسکن، مرجع اولیه ثبت و رسیدگی به شکایات و اعتراض‌ها «سامانه جامع طرح‌های حمایتی مسکن» وزارت راه و شهرسازی است. روند عملی به‌طور خلاصه:

۱) ثبت اعتراض در سامانه:
- به آدرس سامانه ثمن/سامانه طرح‌های حمایتی مسکن (HMR.mrud.ir یا saman.mrud.ir؛ عنوان سامانه ممکن است به‌روزرسانی شود) وارد شوید.
- در پروفایل متقاضی، بخش «اعتراض/ثبت شکایت» فعال است. موضوعات معمول: رد صلاحیت، تطبیق شرایط پنج‌گانه، سابقه مالکیت، فرم «ج»، دهک درآمدی، سابقه استفاده از تسهیلات یارانه‌ای و… .
- مدارک مثبِت را بارگذاری کنید (استعلامات ثبتی، گواهی‌های اشتغال/درآمد، مستندات عدم مالکیت، استعلام تسهیلات بانکی و…).

۲) مرجع رسیدگی در وهله اول:
- کارتابل ...